「魚在水中游」分三個單元劇。
第一個故事《雞泡魚》講述一個緊張子女(江玲、葉峻海飾演)課業的母親(周慧娟飾演)，幫助子女溫習功課時，大發雷霆，父親 (麥炳昌飾演)則埋頭電視，觀看足球賽事，夫妻二人因教導方式爭吵不休。
第二個故事《泥鯭》講述一位女老師(羅冠蘭飾演)，盡心 盡力教導頑劣學生(林招傑 飾演)，終於得到頑劣學生尊重。
第三個故事《食人》講述某中學因去年畢業生曾搞事，為免今年畢業生照樣生事，因此拒絕學生舉行聯歡會，丁老師(林尚武飾 演)為學生力爭舉辦聯歡會，原來學生早已計劃破壞教室，丁老師勸導學生要爭氣，得到班長(王書麒飾演)支持。
明，一个享受厨房乐的广告人，他在三十岁生日的那天，弄了一碗美味而温暖的公仔面给一少女吃过之后，那少女便蓦然地闯进了他的生命。少女 (MILLER) 乐天开朗，一直快乐地活在自己的天地裹。一次的偶然，她在明家过了一晚，在那里尝过明亲手煮的早餐后，她被明的善良和纯真性格所吸引。之后，她主动地贴近明的生活，明的朋友，甚至是明的心。
明有一青梅竹马的女友(EVA)，但在多年前大家已告分手，可是他们之间仍然维系着浓浓的感情，明自己也不明所以，只知道EVA对他是重要的，虽然已不再在爱。直至MILLER的出现，她对生命的热爱及富创造性的生活态度令明走出了他拘谨和拒绝成长的世界，因此也令明了解他对EVA的感情只是一个不愿忘记青春的留恋。同时也令明渐渐爱上这个从天而降的女孩……
胸无大志、性格散漫的周国正（林保怡）虽年过叁十，却事业无成，频频转工；後在母亲的催迫下，毅然投身警界。 一心做个“符录差人”的正在部队中常有失误，终被调往沙头角守边界，期间多次与大陆妹金兰（张可颐）发生误会，认定兰不是好女人，视为灾星。 金兰原籍广西，为生计与友人移居深圳，却找不到工作，只好到卡拉当伴唱，并结识了英俊多情的尹有财（邓浩光），更珠胎暗结。金兰一心相信尹有财会与她结婚，遂将自己所有积蓄献上，助尹有财到英国发展，岂料尹有财自此音讯杳然。 为供养幼子，金兰与友人在中英街开设时装店，更决心改变自己，与正之好友刘敬强（黄智贤）发展，奈何二人性格不合，难以相处，此时兰才发现，自己真正喜欢的原来另有其人……
缘份无边界大结局
国正在中英街截查可疑人，刚发现原来是金吉时，却被人从后袭击。国正怀疑金兰，劝她交出金吉，金兰责他只顾自己升职，国正有理说不...
武林盟主圣剑门五年一次的招收弟子又开始了，吸引众多尚未涉足江湖的年轻人前往应试。成风（黄宗泽 饰）自小就跟着成大娘、大哥成功跑江湖，以卖艺为生，为了有出息，他也前往投考圣剑门。本来凭成风的身手是无法入围的，但武林前辈高手东方无涯（黎耀祥 饰）得知圣剑门今次招考的弟子有机会参与威力无穷的天玄北斗阵的修炼，而且见成风骨格清奇，于是断定他比非池中之物，为通过成风一窥天玄北斗阵的奥妙，于是暗中帮助他顺利考入了圣剑门。同时考入的还有孤傲的荆磊（郑嘉颖 饰）等，成风和一班师兄弟成了好朋友，凭着热心肠，孤傲的荆磊也和他成了肝胆相照的好兄弟。江湖险恶，荆磊在圣剑门发现了当年娘亲身死的秘密，而成风的身世之谜更是他从来没有想到过的，江湖又一场腥风血雨不可避免……
叶菁（杨秀惠 饰）、叶荞（李思欣 饰）和叶茵（陈自瑶 饰）是情同手足的三姐妹，很小的时候，三人曾经于偶然之中遇见过一个神秘的吉普赛女郎（容祖儿 饰），吉普赛女郎预言，叶菁将在十八岁那一年遇见她的真命天子，辨别的标识就是此人身上长了一个如同四叶草一般的胎记。
一晃眼多年过去，就读于清岚国际学校的三姐妹长大成人出落得亭亭玉立。校园内，清岚沙滩排球队声名远扬，其队长于逸臣（司徒瑞祈 饰）更是众女生们心目中的白马王子，让三姐妹没有想到的是，在他的身上，竟然出现了四叶草形状的胎记。然而，叶菁对这一段缘分却多有顾虑，于是叶荞和叶茵只得亲自出马，奔走撮合，谁知两人又在叛逆学生方力（蔡淇俊 饰）的身上发现了同样的胎记，一时之间，她们也无法分辨，叶菁命中注定的那个人究竟是谁。
