影片讲述明朝中叶，宦官专权，大太监李进中主持东厂，上挟天子，下令百官，为虎作伥，陷害忠良。他利用从东瀛人北条夜姬处购买来的黑夜彼岸花炼制奇药，并在平民身上实验以达到自己炼制尸兵鬼侍的目的。在一次次实验失败后急需大量彼岸花，便与北条夜姬约定新的交易地点，便是龙门客栈，这次看似平常交易，暗藏了李进中的大阴谋，龙门客栈暗流涌动，四方云扰，风刀霜剑齐聚于此，在江湖掀起一场血雨腥风。
蓬莱县几任县令离奇死亡，狄仁杰奉命查勘此案，刚刚到达命案再次发生。蒙面刺客刺杀狄仁杰，县尉武勇的离奇救援，使得狄仁杰发现县丞的可疑。然而县丞却突然死在家里，线索指向迷雾森林。追到迷雾森林里，却造埋伏，幸得铁手相救。沿着县丞的线索，探查到东瀛人形迹可疑，待准备捉拿时，却突然杀掉白员外逃跑。白员外的小妾白凤主动要求住进县衙。傍晚时武勇带回来被杀死的东瀛人，而洪姑娘却离奇失踪。夜晚狄仁杰探查东瀛人时，发现疑点，并且布置下圈套，成功地抓住要暗杀狄仁杰的白凤，得到真相在迷雾森林里。狄仁杰带人包围住真凶，发现竟然是县尉武勇，得知事情全部败露的武勇恼羞成怒，要杀掉狄仁杰，最后被众人合力杀死。
